AT1G18580.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : galacturonosyltransferase 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with putative galacturonosyltransferase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
galacturonosyltransferase 11 (GAUT11); FUNCTIONS IN: polygalacturonate 4-alpha-galacturonosyltransferase activity; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 8 (InterPro:IPR002495); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: galacturonosyltransferase 10 (TAIR:AT2G20810.1); Has 1461 Blast hits to 1453 proteins in 263 species: Archae - 0; Bacteria - 484; Metazoa - 143; Fungi - 0; Plants - 819; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 15 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6396144..6398005 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61882.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 537 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRRWPVDHRR RGRRRLSSWI WFLLGSFSVA GLVLFIVQHY HHQQDPSQLL LERDTRTEMV SPPHLNFTEE VTSASSFSRQ LAEQMTLAKA YVFIAKEHNN 101: LHLAWELSSK IRSCQLLLSK AAMRGQPISF DEAKPIITGL SALIYKAQDA HYDIATTMMT MKSHIQALEE RANAATVQTT IFGQLVAEAL PKSLHCLTIK 201: LTSDWVTEPS RHELADENRN SPRLVDNNLY HFCIFSDNVI ATSVVVNSTV SNADHPKQLV FHIVTNRVSY KAMQAWFLSN DFKGSAIEIR SVEEFSWLNA 301: SYSPVVKQLL DTDARAYYFG EQTSQDTISE PKVRNPKYLS LLNHLRFYIP EIYPQLEKIV FLDDDVVVQK DLTPLFSLDL HGNVNGAVET CLEAFHRYYK 401: YLNFSNPLIS SKFDPQACGW AFGMNVFDLI AWRNANVTAR YHYWQDQNRE RTLWKLGTLP PGLLSFYGLT EPLDRRWHVL GLGYDVNIDN RLIETAAVIH 501: YNGNMKPWLK LAIGRYKPFW LKFLNSSHPY LQDCVTA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)