AT1G11280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.996 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-locus lectin protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-locus lectin protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, recognition of pollen; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Curculin-like (mannose-binding) lectin (InterPro:IPR001480), PAN-2 domain (InterPro:IPR013227), Apple-like (InterPro:IPR003609), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), S-locus glycoprotein (InterPro:IPR000858), Tyrosine-protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR020635); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-locus lectin protein kinase family protein (TAIR:AT1G61480.1); Has 119990 Blast hits to 118206 proteins in 4416 species: Archae - 104; Bacteria - 13409; Metazoa - 44077; Fungi - 9917; Plants - 34701; Viruses - 420; Other Eukaryotes - 17362 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3787456..3790728 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 92573.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 830 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDLKENSFEH MGIHLGEIGI VLFPWFLWLS LFLSCGYAAI TISSPLTLGQ TLSSPGGFYE LGFFSPNNSQ NQYVGIWFKK ITPRVVVWVA NREKPITTPV 101: ANLTISRNGS LILLDSSKNV VWSTRRPSIS NKCHAKLLDT GNLVIVDDVS ENLLWQSFEN PGDTMLPYSS LMYNLATGEK RVLSSWKSHT DPSPGDFVVR 201: LTPQVPAQIV TMRGSSVYKR SGPWAKTGFT GVPLMDESYT SPFSLSQDVG NGTGLFSYLQ RSSELTRVII TSEGYLKTFR YNGTGWVLDF ITPANLCDLY 301: GACGPFGLCV TSNPTKCKCM KGFVPKYKEE WKRGNMTSGC MRRTELSCQA NLSTKTQGKG VDVFYRLANV KPPDLYEYAS FVDADQCHQG CLSNCSCSAF 401: AYITGIGCLL WNHELIDTIR YSVGGEFLSI RLASSELAGS RRTKIIVGSI SLSIFVILAF GSYKYWRYRA KQNVGPTWAF FNNSQDSWKN GLEPQEISGL 501: TFFEMNTIRA ATNNFNVSNK LGQGGFGPVY KGTLSDKKDI AVKRLSSSSG QGTEEFMNEI KLISKLQHRN LVRLLGCCID GEEKLLIYEF LVNKSLDTFL 601: FDLTLKLQID WPKRFNIIQG VSRGLLYLHR DSCMRVIHRD LKVSNILLDD KMNPKISDFG LARMFQGTQH QDNTRKVVGT LGYMSPEYAW TGMFSEKSDI 701: YAFGVLLLEI ISGKKISSFC CGEEGKTLLG HAWECWLETG GVDLLDEDIS SSCSPVEVEV ARCVQIGLLC IQQQAVDRPN IAQVVTMMTS ATDLPRPKQP 801: LFALQIQDQE SVVSVSKSVN HVTQTEIYGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)