AT1G07290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 ASURE: golgi What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : golgi nucleotide sugar transporter 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a GDP-mannose transporter. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
golgi nucleotide sugar transporter 2 (GONST2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF250 (InterPro:IPR004853); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: golgi nucleotide sugar transporter 1 (TAIR:AT2G13650.3); Has 1672 Blast hits to 1666 proteins in 234 species: Archae - 0; Bacteria - 5; Metazoa - 480; Fungi - 272; Plants - 768; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 147 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2242284..2244428 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41633.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.80 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 375 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSAVKLEAIV CHEPDESELS HLSDNGSKTK NGVVFQLLDQ KSSEHRWFSE RFLRWRRRYL PVDGDNRRDH GSVKQSGPLV SGAAYCISSC SMIILNKIVL 101: SSYNFNAGVS LMLYQNLISC LVVAVLDISG VVSVEKFNWK LIRVWMPVNV IFVGMLVSGM YSLKYINVAM VTILKNATNI LTGIGEVYMF RKRQNNKVWA 201: AMFMMIISAI SGGITDLTFD AVGYTWQLAN CFLTASYSLT LRRVMDKAKQ STKSGSLNEV SMVLLNNLLS IPFGIILIIL LGEWRYVIST DVTKDSMFWV 301: VATASGFLGL AISFTSMWFL HQTGPTTYSL VGSLNKVPIS LAGLVLFNVP LSLPNLFSIL FGLFAGVVFA RAKMS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)