AT1G06700.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein tyrosine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Tyrosine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008266), Serine-threonine/tyrosine-protein kinase (InterPro:IPR001245), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Protein kinase superfamily protein (TAIR:AT2G30740.1); Has 112305 Blast hits to 111003 proteins in 4429 species: Archae - 103; Bacteria - 13312; Metazoa - 41447; Fungi - 9236; Plants - 31753; Viruses - 344; Other Eukaryotes - 16110 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:2052750..2054552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39821.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 361 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRKWICCTCQ IEDSNEEQQL KSSQQQSDAN HKNSKPAPVA KHEVKKEALP IEVPPLSLDE VKEKTENFGS KALIGEGSYG RVYYATLNDG VAVALKKLDV 101: APEAETDTEF LSQVSMVSRL KHENLIQLLG FCVDGNLRVL AYEFATMGSL HDILHGRKGV QGAQPGPTLD WITRVKIAVE AARGLEYLHE KSQPPVIHRD 201: IRSSNVLLFE DYKAKIADFN LSNQAPDNAA RLHSTRVLGT FGYHAPEYAM TGQLTQKSDV YSFGVVLLEL LTGRKPVDHT MPRGQQSLVT WATPRLSEDK 301: VKQCIDPKLK ADYPPKAVAK LAAVAALCVQ YEAEFRPNMS IVVKALQPLL KPPAAAPAPE S |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)