AT1G04710.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 ASURE: peroxisome What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
EC2.3.1.16 thiolase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 4 (PKT4); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups, catalytic activity, acetyl-CoA C-acyltransferase activity; INVOLVED IN: catechol catabolic process, ortho-cleavage, protocatechuate catabolic process, ortho-cleavage, metabolic process, fatty acid oxidation; LOCATED IN: peroxisome, vacuole; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Thiolase (InterPro:IPR002155), Thiolase, active site (InterPro:IPR020610), Thiolase, N-terminal (InterPro:IPR020616), Thiolase, conserved site (InterPro:IPR020613), Thiolase, C-terminal (InterPro:IPR020617), Thiolase-like, subgroup (InterPro:IPR016038), Thiolase-like (InterPro:IPR016039), Thiolase, acyl-enzyme intermediate active site (InterPro:IPR020615); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: peroxisomal 3-ketoacyl-CoA thiolase 3 (TAIR:AT2G33150.1); Has 22406 Blast hits to 22392 proteins in 2262 species: Archae - 405; Bacteria - 14105; Metazoa - 1004; Fungi - 662; Plants - 281; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 5949 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:1321941..1324556 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46613.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.06 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 443 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEKATERQRI LLRHLQPSSS SDASLSASAC LSKDSAAYQY GDDVVIVAAQ RTALCKAKRG SFKDTFPDEL LASVLRALIE KTNVNPSEVG DIVVGTVLGP 101: GSQRASECRM AAFYAGFPET VPIRTVNRQC SSGLQAVADV AAAIKAGFYD IGIGAGLESM TTNPRGWKGS VNPNVKKFEQ AHNCLLPMGI TSENVAHRFN 201: VSREEQDQAA VDSHRKAASA TASGKFKDEI TPVKTKIVDP KTGDEKPITV SVDDGIRPNT TLSGLAKLKP VFKEDGTTTA GNSSQLSDGA GAVLLMRRNV 301: AMQKGLPILG VFRTFSAVGV DPAIMGVGPA VAIPAAVKAA GLELNDVDLF EINEAFASQF VYCRNKLGLD AEKINVNGGA IAIGHPLGAT GARCVATLLH 401: EMKRRGKDCR FGVVSMCIGS GMGAAAVFER GGGVDELCDV RKV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)