AT1G04630.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GRIM-19 protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
maternal effect embryo arrest 4 (MEE4); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GRIM-19 (InterPro:IPR009346); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GRIM-19 protein (TAIR:AT2G33220.1); Has 332 Blast hits to 332 proteins in 145 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 162; Fungi - 83; Plants - 65; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 22 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:1289921..1290986 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16126.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 143 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTEAMIRNKP GMASVKDMPL LQDGPPPGGF APVRYARRIS NTGPSAMAMF LAVSGAFAWG MYQVGQGNKI RRALKEEKYA ARRTILPILQ AEEDERFVSE 101: WKKYLEYEAD VMKDVPGWKV GENVYNSGRW MPPATGELRP DVW |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)