AT1G01950.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 0.987 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : armadillo repeat kinesin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the armadillo/beta-catenin repeat kinesin motor family. Mutants have twisted roots due to abnormal cell file rotation; the phenotype is dependent on microtubules. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
armadillo repeat kinesin 2 (ARK2); FUNCTIONS IN: microtubule motor activity, binding, ATP binding; INVOLVED IN: root development; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Kinesin, motor region, conserved site (InterPro:IPR019821), Armadillo-like helical (InterPro:IPR011989), Armadillo (InterPro:IPR000225), Armadillo-type fold (InterPro:IPR016024), Kinesin, motor domain (InterPro:IPR001752); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: armadillo repeat kinesin 3 (TAIR:AT1G12430.1); Has 19604 Blast hits to 16795 proteins in 739 species: Archae - 69; Bacteria - 853; Metazoa - 8320; Fungi - 2122; Plants - 2828; Viruses - 22; Other Eukaryotes - 5390 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:325473..330403 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 98428.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 894 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMASSRNGA VRGSMRPVSG ANSSNLRSSS FKSRIPSSAP APRRSSSASI GAADNGVPGR VRVAVRLRPR NADESVADAD FADCVELQPE LKRLKLRKNN 101: WDTETYEFDE VLTEAASQKR VYEVVAKPVV ESVLEGYNGT VMAYGQTGTG KTFTLGRLGD EDTAARGIMV RSMEDIIGGT SLDTDSISVS YLQLYMETIQ 201: DLLDPTNDNI AIVEDPRTGD VSLPGATHVE IRNQQNFLEL LQLGETHRVA ANTKLNTESS RSHAILMVHV KRSVVENEFP VSNEMESSSH FVRPSKPLVR 301: RSKLVLVDLA GSERVHKSGS EGHMLEEAKS INLSLSALGK CINAIAENSP HVPLRDSKLT RLLRDSFGGT ARTSLIVTIG PSPRHRGETT STILFGQRAM 401: KVENMLKIKE EFDYKSLSKK LEVQLDKVIA ENERQLKAFD DDVERINRQA QNRISEVEKN FAEALEKEKL KCQMEYMESV KKLEEKLISN QRNHENGKRN 501: GEVNGVVTAS EFTRLKESLE NEMKLRKSAE EEVSKVKSQS TLKTRSGEGE DAGITRLQKL LEDEALQKKK LEEEVTILRS QLVQLTFEAD QMRRCLDRGA 601: PGNSYSGTDS LPSRHSQARE SVNGQKAPFA TLCEQVGLQK ILQLLESDDA NIRIHAVKVV ANLAAEEANQ EKIVEAGGLT SLLMLLRSYE DETVRRVAAG 701: AIANLAMNEV SQQLIVDQGG ISLLSLTAAD AEDPQTLRMV AGAIANLCGN DKLQARLWSD GGIKALLGMV RCGHPDVLAQ VARGIANFAK CESRATTQGV 801: KSGRSLLIED GALPWIVQHA NDEAAPIRRH IELALCHLAQ HEVNAKEMIS GGALWELVRI SKECSREDIR SLAHRTLSSS PVFRSEIRRL GIQF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)