AT5G55280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homolog of bacterial cytokinesis Z-ring protein FTSZ 1-1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes one of two FtsZ proteins, tubulin-like proteins, in Arabidopsis. It is involved in chloroplast division. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
homolog of bacterial cytokinesis Z-ring protein FTSZ 1-1 (FTSZ1-1); FUNCTIONS IN: protein binding, structural molecule activity; INVOLVED IN: chloroplast fission, plastid fission; LOCATED IN: chloroplast stroma, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cell division protein FtsZ, N-terminal (InterPro:IPR000158), Tubulin, conserved site (InterPro:IPR017975), Cell division protein FtsZ, conserved site (InterPro:IPR020805), Tubulin/FtsZ, GTPase domain (InterPro:IPR003008), Tubulin/FtsZ, N-terminal (InterPro:IPR019746), Tubulin/FtsZ, C-terminal (InterPro:IPR008280), Tubulin/FtsZ, 2-layer sandwich domain (InterPro:IPR018316); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Tubulin/FtsZ family protein (TAIR:AT3G52750.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:22420740..22422527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 45567.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 433 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIIPLAQLN ELTISSSSSS FLTKSISSHS LHSSCICASS RISQFRGGFS KRRSDSTRSK SMRLRCSFSP MESARIKVIG VGGGGNNAVN RMISSGLQSV 101: DFYAINTDSQ ALLQSSAENP LQIGELLTRG LGTGGNPLLG EQAAEESKDA IANALKGSDL VFITAGMGGG TGSGAAPVVA QISKDAGYLT VGVVTYPFSF 201: EGRKRSLQAL EAIEKLQKNV DTLIVIPNDR LLDIADEQTP LQDAFLLADD VLRQGVQGIS DIITIPGLVN VDFADVKAVM KDSGTAMLGV GVSSSKNRAE 301: EAAEQATLAP LIGSSIQSAT GVVYNITGGK DITLQEVNRV SQVVTSLADP SANIIFGAVV DDRYTGEIHV TIIATGFSQS FQKTLLTDPR AAKLLDKMGS 401: SGQQENKGMS LPHQKQSPST ISTKSSSPRR LFF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)