AT5G46290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase I | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase I (KAS I) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
3-ketoacyl-acyl carrier protein synthase I (KAS I); FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups, fatty acid synthase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: biosynthetic process, metabolic process, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma, membrane, chloroplast envelope; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-ketoacyl synthase (InterPro:IPR000794), Polyketide synthase, beta-ketoacyl synthase region (InterPro:IPR020841), Thiolase-like (InterPro:IPR016039), Beta-ketoacyl synthase, C-terminal (InterPro:IPR014031), 3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase 2 (InterPro:IPR017568), Beta-ketoacyl synthase, N-terminal (InterPro:IPR014030), Thiolase-like, subgroup (InterPro:IPR016038), Beta-ketoacyl synthase, active site (InterPro:IPR018201); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fatty acid biosynthesis 1 (TAIR:AT1G74960.3); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:18774439..18776629 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50416.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 473 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQALQSSSLR ASPPNPLRLP SNRQSHQLIT NARPLRRQQR SFISASASTV SAPKRETDPK KRVVITGMGL VSVFGNDVDA YYEKLLSGES GISLIDRFDA 101: SKFPTRFGGQ IRGFSSEGYI DGKNERRLDD CLKYCIVAGK KALESANLGG DKLNTIDKRK AGVLVGTGMG GLTVFSEGVQ NLIEKGHRRI SPFFIPYAIT 201: NMGSALLAID LGLMGPNYSI STACATSNYC FYAAANHIRR GEADMMIAGG TEAAIIPIGL GGFVACRALS QRNDDPQTAS RPWDKARDGF VMGEGAGVLV 301: MESLEHAMKR GAPIVAEYLG GAVNCDAHHM TDPRADGLGV SSCIERCLED AGVSPEEVNY INAHATSTLA GDLAEINAIK KVFKSTSGIK INATKSMIGH 401: CLGAAGGLEA IATVKAINTG WLHPSINQFN PEQAVDFDTV PNEKKQHEVD VAISNSFGFG GHNSVVAFSA FKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)