AT4G31050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 0.643 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Biotin/lipoate A/B protein ligase family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Biotin/lipoate A/B protein ligase family; FUNCTIONS IN: lipoyltransferase activity, octanoyltransferase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: protein modification process, lipoate biosynthetic process; LOCATED IN: cytoplasm; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Octanoyltransferase, conserved site (InterPro:IPR020605), Octanoyltransferase (InterPro:IPR000544), Biotin/lipoate A/B protein ligase (InterPro:IPR004143); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Biotin/lipoate A/B protein ligase family (TAIR:AT1G47578.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:15114345..15115443 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 31860.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 278 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MELLNGVETL VSGIHHHHRT NAKRNRLVRS VKILNSGNHE IPRKCLCFDL YDKLVPYKKA WSWQKSIVEE KKTLIDRNQD CADTVILLQH SPVYTMGTAS 101: TEDYLNFDIK DAPFNVYRTE RGGEVTYHGP GQLVMYPIIN LRNHEMDLHW YLRMLEEIVI RVLSSTFSIK ASRLDGLTGV WVGNQKVAAI GIRVSKWITY 201: HGLALNVTTD LTPFNWIVPC GIRDRKVGNI KGLLEDGEHG MVDDLRLIDI VHESLLKEFS EAFQLQIEKQ TVSDPNIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)