AT4G18270.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.484 vacuole 0.425 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : translocase 11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes protein similar to similar to bacterial translocase I (mra Y). Expressed during flower bud development. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
translocase 11 (TRANS11); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide transferase, conserved site (InterPro:IPR018480), Phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide transferase (InterPro:IPR003524), Glycosyl transferase, family 4 (InterPro:IPR000715), Glycosyl transferase, family 4, conserved region (InterPro:IPR018481); Has 1367 Blast hits to 1365 proteins in 548 species: Archae - 16; Bacteria - 1334; Metazoa - 1; Fungi - 0; Plants - 14; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:10099364..10101897 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 51722.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 480 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRCSLLTPTS YRFHYPNPFR SLESIPPLSN SRYRIESGSP SSFKFSAPSL QRHSSVSVKA FDDDTFDFYT GDIFAATYAI SSSEGEESDG DYALNVVTET 101: TAQKLGKFPR GRKKHRIRYG INLGLLAFLS LLLLLMDSFA WKIVRLPLPP YFLSMPFFTS AILVTLAGYI FVPLLDRLRV HEPIRTLGPV PHNRRPTIPT 201: MGGLFFVPIG VVVAIALNKV SSIEVLGAAA ATVAFAAIGL IDDSLSLYSE NNNGLSAKIQ LLLEAAVGTC FAFWLETASL SSPYGMKMLV PLPSPLGLVF 301: LGKLYLLLTS FYFVSMGNLV KATDGLDGLA GGIAALCFVA MAIAVLPICS DLSVFGASMA GACFGFLLHN RYRASVSMGD TGSLALGGAL AAMAACSGMF 401: FPLFISSGVA VLEASSVIIQ VVYYSTTKRL KGKGRRIFKT IPFHHHLRLN GLKEPMIVTM AYVISSLLSL SAAYIGLISA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)