AT4G01070.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.428 vacuole 0.373 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
the glycosyltransferase (UGT72B1) is involved in metabolizing xenobiotica (chloroaniline and chlorophenole). Comparison between wild type and knock-out mutant demonstrates the central role of this gene for metabolizing chloroaniline but significantly less for chlorophenole. The glucosyltransferase preferred UDP-xylose over UDP-glucose indicating its (additional) functioning as a xylosyltransferase in planta | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
GT72B1; FUNCTIONS IN: UDP-glycosyltransferase activity, UDP-glucosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: xenobiotic metabolic process, response to cyclopentenone, response to salt stress, response to toxin, xenobiotic catabolic process; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glucosyl transferase 72B3 (TAIR:AT1G01420.1); Has 7551 Blast hits to 7483 proteins in 336 species: Archae - 0; Bacteria - 81; Metazoa - 2271; Fungi - 41; Plants - 5061; Viruses - 34; Other Eukaryotes - 63 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:461858..463300 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52932.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 480 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEESKTPHVA IIPSPGMGHL IPLVEFAKRL VHLHGLTVTF VIAGEGPPSK AQRTVLDSLP SSISSVFLPP VDLTDLSSST RIESRISLTV TRSNPELRKV 101: FDSFVEGGRL PTALVVDLFG TDAFDVAVEF HVPPYIFYPT TANVLSFFLH LPKLDETVSC EFRELTEPLM LPGCVPVAGK DFLDPAQDRK DDAYKWLLHN 201: TKRYKEAEGI LVNTFFELEP NAIKALQEPG LDKPPVYPVG PLVNIGKQEA KQTEESECLK WLDNQPLGSV LYVSFGSGGT LTCEQLNELA LGLADSEQRF 301: LWVIRSPSGI ANSSYFDSHS QTDPLTFLPP GFLERTKKRG FVIPFWAPQA QVLAHPSTGG FLTHCGWNST LESVVSGIPL IAWPLYAEQK MNAVLLSEDI 401: RAALRPRAGD DGLVRREEVA RVVKGLMEGE EGKGVRNKMK ELKEAACRVL KDDGTSTKAL SLVALKWKAH KKELEQNGNH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)