AT4G00960.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 0.408 vacuole 0.333 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Protein kinase superfamily protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: stem, leaf; EXPRESSED DURING: LP.10 ten leaves visible; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: cysteine-rich RLK (RECEPTOR-like protein kinase) 41 (TAIR:AT4G00970.1); Has 115688 Blast hits to 114341 proteins in 4243 species: Archae - 87; Bacteria - 12866; Metazoa - 42714; Fungi - 9727; Plants - 32895; Viruses - 425; Other Eukaryotes - 16974 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:414361..416180 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42533.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 372 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MKVDFLVIKV EKLSSLRVFY FFLFFFESKY VEDQKIKDAK LLQLDFDTIR LATNDFSPYN HLGEGGFGAV YKGVLDSGEE IAVKRLSMKS GQGDNEFVNE 101: VSLVAKLQHR NLVRLLGFCF KGEERLLIYE FFKNTSLEKR MILDWEKRYR IISGVARGLL YLHEDSHFKI IHRDMKASNV LLDDAMNPKI ADFGMVKLFN 201: TDQTSQTMFT SKVAGTYGYM APEYAMSGQF SVKTDVFSFG VLVLEIIKGK KNNWSPEEQS SLFLLSYVWK CWREGEVLNI VDPSLIETRG LSDEIRKCIH 301: IGLLCVQENP GSRPTMASIV RMLNANSFTL PRPLQPAFYS GVVDSSSRDN NHTRNPRIAS LNDVTITELD PR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)