AT3G51850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : calcium-dependent protein kinase 13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Calcium Dependent Protein Kinase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
calcium-dependent protein kinase 13 (CPK13); FUNCTIONS IN: in 6 functions; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation, N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), EF-Hand 1, calcium-binding site (InterPro:IPR018247), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Calcium-binding EF-hand (InterPro:IPR002048), EF-hand-like domain (InterPro:IPR011992), EF-hand (InterPro:IPR018248), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), EF-HAND 2 (InterPro:IPR018249), Calcium-dependent protein kinase (InterPro:IPR020642), Calcium/calmodulin-dependent protein kinase-like (InterPro:IPR020636); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: calcium-dependent protein kinase 30 (TAIR:AT1G74740.1); Has 124889 Blast hits to 118841 proteins in 3848 species: Archae - 180; Bacteria - 14009; Metazoa - 46910; Fungi - 16716; Plants - 24454; Viruses - 407; Other Eukaryotes - 22213 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:19232667..19235526 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59379.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.65 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 528 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNCCRSPAA VAREDVKSNY SGHDHARKDA AGGKKSAPIR VLSDVPKENI EDRYLLDREL GRGEFGVTYL CIERSSRDLL ACKSISKRKL RTAVDIEDVK 101: REVAIMKHLP KSSSIVTLKE ACEDDNAVHL VMELCEGGEL FDRIVARGHY TERAAAGVTK TIVEVVQLCH KHGVIHRDLK PENFLFANKK ENSPLKAIDF 201: GLSIFFKPGE KFSEIVGSPY YMAPEVLKRN YGPEIDIWSA GVILYILLCG VPPFWAESEQ GVAQAILRGV IDFKREPWPN ISETAKNLVR QMLEPDPKRR 301: LTAKQVLEHP WIQNAKKAPN VPLGDVVKSR LKQFSVMNRF KRKALRVIAE FLSTEEVEDI KVMFNKMDTD NDGIVSIEEL KAGLRDFSTQ LAESEVQMLI 401: EAVDTKGKGT LDYGEFVAVS LHLQKVANDE HLRKAFSYFD KDGNGYILPQ ELCDALKEDG GDDCVDVAND IFQEVDTDKD GRISYEEFAA MMKTGTDWRK 501: ASRHYSRGRF NSLSIKLMKD GSLNLGNE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)