AT3G24500.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : multiprotein bridging factor 1C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
One of three genes in A. thaliana encoding multiprotein bridging factor 1, a highly conserved transcriptional coactivator. May serve as a bridging factor between a bZIP factor and TBP. Its expression is specifically elevated in response to pathogen infection, salinity, drought, heat, hydrogen peroxide, and application of abscisic acid or salicylic acid. Constitutive expression enhances the tolerance of transgenic plants to various biotic and abiotic stresses. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
multiprotein bridging factor 1C (MBF1C); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Lambda repressor-like, DNA-binding (InterPro:IPR010982), Multiprotein bridging factor 1, N-terminal (InterPro:IPR013729), Helix-turn-helix type 3 (InterPro:IPR001387); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: multiprotein bridging factor 1B (TAIR:AT3G58680.1); Has 715 Blast hits to 715 proteins in 278 species: Archae - 65; Bacteria - 30; Metazoa - 196; Fungi - 149; Plants - 136; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 137 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:8918755..8919201 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 16404.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 148 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPSRYPGAVT QDWEPVVLHK SKQKSQDLRD PKAVNAALRN GVAVQTVKKF DAGSNKKGKS TAVPVINTKK LEEETEPAAM DRVKAEVRLM IQKARLEKKM 101: SQADLAKQIN ERTQVVQEYE NGKAVPNQAV LAKMEKVLGV KLRGKIGK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)