AT3G21110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : purin 7 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
5'-phosphoribosyl-4-(N-succinocarboxamide)-5-aminoimidazole synthetase (PUR7, syn. SAICAR synthetase), catalyzes aspartate addition at the alpha-amino group to the growing purine backbone. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
purin 7 (PUR7); FUNCTIONS IN: phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase activity; INVOLVED IN: response to auxin stimulus, purine nucleotide biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: SAICAR synthetase, conserved site (InterPro:IPR018236), ATP-grasp fold, subdomain 2 (InterPro:IPR013816), SAICAR synthetase (InterPro:IPR001636); Has 6539 Blast hits to 6539 proteins in 2290 species: Archae - 136; Bacteria - 4333; Metazoa - 76; Fungi - 152; Plants - 62; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1780 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:7402696..7405273 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46065.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 411 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAQCVRSTLN PVRTPQSFTR KAYVKSPAFA SVSFLRAVPE FNKYPKPCSL VMSCQGKAQN QQEERPQLSL DDLVTSNRKG EVLGTIKDSL SNCLSETNLL 101: ATVPGLKSRI KGKVRDIYDA GDYLVLITTD RLSAFDRNLA SIPFKGQVLN ETSLWWFNNT QHITPNAIVS SPDRNVVIAK KCSVFPIEFV VRGYVTGSTD 201: TSLWTVYNKG VRNYCGNELS DGLVKNQKLP ANILTPTTKA ADHDVPISPN EIVEGGFMTQ AEFDEASMKA LSLFEFGQGV AKKHGLILVD TKYEFGRSSD 301: GSILLIDEIH TPDSSRYWLA GSYEERFQKG LEPENVDKEF LRLWFKENCN PYEDEVLPAA PAELVTELAW RYIFLYETIT GSRIDIIPTQ EPIHDRISRN 401: TSQALSSLRQ L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)