AT3G07480.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, iron-sulfur cluster binding; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferredoxin (InterPro:IPR001041), Beta-grasp fold, ferredoxin-type (InterPro:IPR012675); Has 1263 Blast hits to 1263 proteins in 213 species: Archae - 0; Bacteria - 293; Metazoa - 132; Fungi - 8; Plants - 41; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 789 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2389026..2389505 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17603.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 159 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTLQKLSS QIHRLSPFTR SLIVRTSATS APSPSLGSKK VSDRIVKLSA IDPDGYKQDI IGLSGQTLLR ALTHTGLIDP ASHRLDDIEA CSAECEVQIA 101: EEWLEKLPPR TYDEEYVLKR SSRSRILNKH SRLGCQVVLT QELQGMVVAV PEAKPWDIP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)