AT3G07110.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Ribosomal protein L13 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Ribosomal protein L13 family protein; FUNCTIONS IN: structural constituent of ribosome; INVOLVED IN: translation; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ribosomal protein L13 (InterPro:IPR005822), Ribosomal protein L13, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR005755); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ribosomal protein L13 family protein (TAIR:AT5G48760.2); Has 2682 Blast hits to 2682 proteins in 901 species: Archae - 297; Bacteria - 971; Metazoa - 344; Fungi - 193; Plants - 326; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 551 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:2252092..2253332 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 23467.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 11.09 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 206 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVSGSGICAK RVVVDARHHM LGRLASVVAK DLLNGQNIVV VRCEEICLSG GLVRQKMKYM RFLRKRMNTK PSHGPIHFRA PSKIFWRTVR GMIPHKTKRG 101: ANALARLKVF EGVPTPYDKI KRMVVPDALK VLRLQAGHKY CLLGRLSSEV GWNHYDTIKE LENKRKERAQ AVYERKKQLS KLRAKAEKVA EEKLGSQLDV 201: LAPVKY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)