AT3G01550.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoenolpyruvate (pep)/phosphate translocator 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphoenolpyruvate (pep)/phosphate translocator 2 (PPT2); FUNCTIONS IN: antiporter activity; INVOLVED IN: transport; LOCATED IN: integral to membrane, chloroplast, membrane; EXPRESSED IN: 19 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein of unknown function DUF6, transmembrane (InterPro:IPR000620), Tpt phosphate/phosphoenolpyruvate translocator (InterPro:IPR004696), Protein of unknown function DUF250 (InterPro:IPR004853); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glucose-6-phosphate/phosphate translocator-related (TAIR:AT5G33320.1); Has 2511 Blast hits to 2510 proteins in 289 species: Archae - 8; Bacteria - 55; Metazoa - 551; Fungi - 395; Plants - 1226; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 276 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:216947..218856 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42056.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 383 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFALTFLNPN PRLPSPLFLA KSTPESALSR RSRAFSSSNS YPWRPNLRFN GFKLKSATVP ENVEGGDLES GSLVKGLKLG GMFGVWYLLN IYYNIFNKQV 101: LRVYPYPATV TAFQLGCGTL MIAIMWLLKL HPRPKFSPSQ FTVIVQLAVA HTLGNLLTNV SLGRVNVSFT HTIKAMEPFF TVLLSVLLLG EWPSLWIVCS 201: LLPIVAGVSL ASFTEASFNW IGFCSAMASN VTNQSRNVLS KKFMVGKDAL DNINLFSIIT IISFILLVPL AILIDGFKVT PSHLQVATSQ GLSVKEFCIM 301: SLLAGVCLHS YQQVSYMILE MVSPVTHSVG NCVKRVVVIT SSILFFKTPV SPLNSIGTAT ALAGVYLYSR AKRVQVKPNP KMS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)