AT2G43360.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Radical SAM superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Catalyzes the conversion of dethiobiotin to biotin. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BIOTIN AUXOTROPH 2 (BIO2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Biotin/thiamin synthesis-associated protein (InterPro:IPR010722), Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Elongator protein 3/MiaB/NifB (InterPro:IPR006638), Radical SAM (InterPro:IPR007197), Biotin synthase (InterPro:IPR002684); Has 5366 Blast hits to 5366 proteins in 2012 species: Archae - 191; Bacteria - 4453; Metazoa - 6; Fungi - 120; Plants - 75; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 521 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:18010918..18013129 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41683.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.97 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 378 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMLVRSVFRS QLRPSVSGGL QSASCYSSLS AASAEAERTI REGPRNDWSR DEIKSVYDSP LLDLLFHGAQ VHRHVHNFRE VQQCTLLSIK TGGCSEDCSY 101: CPQSSRYSTG VKAQRLMSKD AVIDAAKKAK EAGSTRFCMG AAWRDTIGRK TNFSQILEYI KEIRGMGMEV CCTLGMIEKQ QALELKKAGL TAYNHNLDTS 201: REYYPNVITT RSYDDRLETL SHVRDAGINV CSGGIIGLGE AEEDRIGLLH TLATLPSHPE SVPINALLAV KGTPLEDQKP VEIWEMIRMI GTARIVMPKA 301: MVRLSAGRVR FSMSEQALCF LAGANSIFTG EKLLTTPNND FDADQLMFKT LGLIPKPPSF SEDDSESENC EKVASASH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)