AT2G35040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : AICARFT/IMPCHase bienzyme family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
AICARFT/IMPCHase bienzyme family protein; FUNCTIONS IN: phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase activity, IMP cyclohydrolase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: response to cold, purine nucleotide biosynthetic process; LOCATED IN: stromule, chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: AICARFT/IMPCHase bienzyme, transformylase domain (InterPro:IPR013982), AICARFT/IMPCHase bienzyme (InterPro:IPR002695), MGS-like (InterPro:IPR011607); Has 10802 Blast hits to 10325 proteins in 2522 species: Archae - 69; Bacteria - 5512; Metazoa - 346; Fungi - 183; Plants - 62; Viruses - 6; Other Eukaryotes - 4624 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:14765347..14768269 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 64910.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.91 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 596 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLSSAATATS VSARSGDILC GLFRKKSVAP FRFTQPVYRT SLCPSFVAVR AMAESQTAQR NQPQSSGSSG EKQALISLSD KRDLASLGNG LQELGYTIVS 101: TGGTASTLEN AGVSVTKVEK LTHFPEMLDG RVKTLHPNIH GGILARRDVE HHMEALNEHG IGTFDVVVVN LYPFYEKVTA PGGISFEDGI ENIDIGGPAM 201: IRAAAKNHKD VLIVVDSGDY QAVLEYLKGG QSDQQFRRKL AWKAFQHVAA YDSAVSEWLW KQTEGKEKFP PSFTVPLVLK SSLRYGENPH QKAAFYVDKS 301: LAEVNAGGIA TAIQHHGKEM SYNNYLDADA AWNCVSEFEN PTCVVVKHTN PCGVASRDDI LEAYRLAVKA DPVSAFGGIV AFNVEVDEVL AREIREFRSP 401: TDGETRMFYE IVVAPKYTAK GLEVLKGKSK TLRILEAKKN DQGKLSLRQV GGGWLAQDSD DLTPEDISFN SVSDKTPTES ELADAKFAWL CVKHVKSNAI 501: VIAKNNCMLG MGSGQPNRVE SLRIAFKKAG EEAKGAALAS DAFFPFAWKD AVEEACQMGI GVIAEPGGSI RDQDAIDCCK KYGVSLLFTN VRHFRH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)