AT2G31390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : pfkB-like carbohydrate kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
pfkB-like carbohydrate kinase family protein; FUNCTIONS IN: kinase activity, ribokinase activity; INVOLVED IN: D-ribose metabolic process, acetate fermentation, sucrose biosynthetic process, sucrose catabolic process, using beta-fructofuranosidase; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Carbohydrate/purine kinase (InterPro:IPR011611), Ribokinase (InterPro:IPR002139), Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site (InterPro:IPR002173); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: pfkB-like carbohydrate kinase family protein (TAIR:AT1G06030.1); Has 18509 Blast hits to 18503 proteins in 2397 species: Archae - 386; Bacteria - 14053; Metazoa - 143; Fungi - 116; Plants - 466; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3345 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13383635..13386116 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35277.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 325 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASNGDKGLI VSFGEMLIDF VPTESGVSLA EAPGFLKAPG GAPANVAIAV SRLGGRSAFV GKLGDDEFGH MLAGILRKNG VDDQGINFDT GARTALAFVT 101: LRADGDREFM FYRNPSADML LRPDELNLDL IRSAKVFHYG SISLIVEPCR SAHLKAMEVA KEAGALLSYD PNLREPLWPS KEEAKTQIMS IWDKAEIIKV 201: SDVELEFLTG SNKIDDETAL TLWHPNLKLL LVTLGEKGCR YYTKTFKGAV DPFHVNAVDT TGAGDSFVGA LLNQIVDDRS VLEDEERLRK VLRFANACGA 301: ITTTKKGAIP ALPSDAEVRS FLEKK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)