AT2G30200.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : catalytics;transferases;[acyl-carrier-protein] S-malonyltransferases;binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
catalytics;transferases;[acyl-carrier-protein] S-malonyltransferases;binding; FUNCTIONS IN: binding, transferase activity, [acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: fatty acid biosynthetic process, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast, chloroplast stroma; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase (InterPro:IPR016035), Malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase (InterPro:IPR004410), Acyl transferase domain (InterPro:IPR001227), Acyl transferase (InterPro:IPR014043), Malonyl-CoA ACP transacylase, ACP-binding (InterPro:IPR016036); Has 16466 Blast hits to 15045 proteins in 2783 species: Archae - 4; Bacteria - 12057; Metazoa - 203; Fungi - 1221; Plants - 66; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2915 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:12883162..12885482 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41524.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.83 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 393 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MRSLLHRTIL LTSPSHSLIR RTSLSAMATT ASSSLLLPSI SLNNLSSSKN ASFGFAAKNL SRSRISMSVS AGSQSTTVHD SLFADYKPTS AFLFPGQGAQ 101: AVGMGKESQS VGAAGELYKK ANDILGYDLL DICVNGPKEK LDSTVISQPA IYVTSLAAVE LLRVREGGEQ IINSVDVTCG LSLGEYTALA FAGAFSFEDG 201: LKLVKLRGEA MQAAADAAKS AMVSIIGLDS EKVQQLCDAA NQEVDEADKV QIANYLCPGN YAVSGGLKGI EVVEAKAKSF KARMTVRLAV AGAFHTSFME 301: PAVSRLEAAL AATEIRSPRI PVISNVDAQP HADPDTIKKI LARQVTSPVQ WETTVKTLLS KGLKSSYELG PGKVIAGIFK RVDKSASFEN ISA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)