AT2G26150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : heat shock transcription factor A2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of Heat Stress Transcription Factor (Hsf) family. Involved in response to misfolded protein accumulation in the cytosol. Regulated by alternative splicing and non-sense-mediated decay. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
heat shock transcription factor A2 (HSFA2); FUNCTIONS IN: DNA binding, transcription activator activity, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: in 7 processes; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, C globular stage, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Winged helix-turn-helix transcription repressor DNA-binding (InterPro:IPR011991), Heat shock factor (HSF)-type, DNA-binding (InterPro:IPR000232); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: heat shock transcription factor A6B (TAIR:AT3G22830.1); Has 2162 Blast hits to 2147 proteins in 231 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 326; Fungi - 474; Plants - 849; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 513 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:11135856..11137217 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 39116.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.90 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.58 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 345 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEELKVEMEE ETVTFTGSVA ASSSVGSSSS PRPMEGLNET GPPPFLTKTY EMVEDPATDT VVSWSNGRNS FVVWDSHKFS TTLLPRYFKH SNFSSFIRQL 101: NTYGFRKIDP DRWEFANEGF LAGQKHLLKN IKRRRNMGLQ NVNQQGSGMS CVEVGQYGFD GEVERLKRDH GVLVAEVVRL RQQQHSSKSQ VAAMEQRLLV 201: TEKRQQQMMT FLAKALNNPN FVQQFAVMSK EKKSLFGLDV GRKRRLTSTP SLGTMEENLL HDQEFDRMKD DMEMLFAAAI DDEANNSMPT KEEQCLEAMN 301: VMMRDGNLEA ALDVKVEDLV GSPLDWDSQD LHDMVDQMGF LGSEP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)