AT2G22230.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Thioesterase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Thioesterase superfamily protein; FUNCTIONS IN: crotonoyl-[acyl-carrier-protein] hydratase activity, 3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase activity; INVOLVED IN: defense response to fungus, incompatible interaction, fatty acid biosynthetic process; LOCATED IN: cell wall, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ (InterPro:IPR013114), Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ (InterPro:IPR010084); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thioesterase superfamily protein (TAIR:AT5G10160.1); Has 7405 Blast hits to 7398 proteins in 2208 species: Archae - 0; Bacteria - 5424; Metazoa - 2; Fungi - 0; Plants - 85; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1894 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:9450042..9451427 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24243.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 220 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATTSNSVLF LSSDSLIHHH HHQPLHLSSS RSHSVSLPPN KRSNSLTLRC STNGDSTSTE KETPIELKFP AFPTVMDINQ IREILPHRFP FLLVDRVIEY 101: TPGVSAVAIK NVTINDNFFP GHFPERPIMP GVLMIEAMAQ VGGIVMLQPE VGGSQDNFFF AGIDKVRFRK PVIAGDTLVM RMTLLKFQKR FGLAKMEGKA 201: YVGGALVCEG EFMMVSAGSS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)