AT1G78050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase (PGM); FUNCTIONS IN: intramolecular transferase activity, phosphotransferases, catalytic activity; INVOLVED IN: response to nitrate, metabolic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 18 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidine phosphatase superfamily, clade-1 (InterPro:IPR013078), Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase, active site (InterPro:IPR001345), Phosphoglycerate mutase 1 (InterPro:IPR005952); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoglycerate mutase family protein (TAIR:AT1G22170.1); Has 11796 Blast hits to 11695 proteins in 2243 species: Archae - 59; Bacteria - 8243; Metazoa - 598; Fungi - 291; Plants - 140; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2465 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:29348095..29349592 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37217.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 332 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSTTMSHQ AIGSVVSQRP FKASQFLKEP LNNVPMKFRQ KRFKIEATAS QISVVDNTFL SPSPSKNKPH ESKKKSNEAA LILIRHGESL WNEKNLFTGC 101: VDVPLTQKGV GEAIEAGKKI SNIPVDLIFT SSLIRAQMTA MLAMTQHRRK KVPIILHNES VKAKTWSHVF SEETRKQSIP VIAAWQLNER MYGELQGLNK 201: KETAERYGTQ QVHEWRRSYE IPPPKGESLE MCAERAVAYF EDNIKPELAS GNNVMIAAHG NSLRSIIMYL DDLTSQEVTT LDLSTGVPLL YIFKEGKFMK 301: RGSPVGSTEA GVYAYTKRLA QYREKLDAAA TI |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)