AT1G30520.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : acyl-activating enzyme 14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a chloroplast O-succinylbenzoyl-CoA ligase. Involved in phylloquinone biosynthesis. Knock mutant is seedling lethal. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
acyl-activating enzyme 14 (AAE14); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: AMP-binding, conserved site (InterPro:IPR020845), AMP-dependent synthetase/ligase (InterPro:IPR000873); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: AMP-dependent synthetase and ligase family protein (TAIR:AT4G19010.1); Has 73301 Blast hits to 67448 proteins in 3614 species: Archae - 1088; Bacteria - 49563; Metazoa - 3259; Fungi - 3557; Plants - 2200; Viruses - 1; Other Eukaryotes - 13633 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:10811039..10813546 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 61920.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.18 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 560 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANHSRPHIC QCLTRLASVK RNAVVTVYGN RKRTGREFVD GVLSLAAGLI RLGLRNGDVV SIAAFNSDLF LEWLLAVALV GGVVAPLNYR WSLKEAKMAM 101: LLVEPVLLVT DETCVSWCID VQNGDIPSLK WRVLMESTST DFANELNQFL TTEMLKQRTL VPSLATYAWA SDDAVVICFT SGTTGRPKGV TISHLAFITQ 201: SLAKIAIAGY GEDDVYLHTS PLVHIGGLSS AMAMLMVGAC HVLLPKFDAK TALQVMEQNH ITCFITVPAM MADLIRVNRT TKNGAENRGV RKILNGGGSL 301: SSELLKEAVN IFPCARILSA YGMTEACSSL TFMTLHDPTQ ESFKVTYPLL NQPKQGTCVG KPAPHIELMV KLDEDSSRVG KILTRGPHTM LRYWGHQVAQ 401: ENVETSESRS NEAWLDTGDI GAFDEFGNLW LIGRSNGRIK TGGENVYPEE VEAVLVEHPG IVSAVVIGVI DTRLGEMVVA CVRLQEKWIW SDVENRKGSF 501: QLSSETLKHH CRTQNLTGFK IPKRFVRWEK QFPLTTTGKV KRDEVRRQVL SHFQIMTSSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)