AT1G24280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : glucose-6-phosphate dehydrogenase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a plastidic glucose-6-phosphate dehydrogenase that is sensitive to reduction by DTT and whose mRNA is most highly expressed in root. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
glucose-6-phosphate dehydrogenase 3 (G6PD3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glucose-6-phosphate dehydrogenase, C-terminal (InterPro:IPR022675), Glucose-6-phosphate dehydrogenase, active site (InterPro:IPR019796), NAD(P)-binding domain (InterPro:IPR016040), Glucose-6-phosphate dehydrogenase (InterPro:IPR001282), Glucose-6-phosphate dehydrogenase, NAD-binding (InterPro:IPR022674); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: glucose-6-phosphate dehydrogenase 2 (TAIR:AT5G13110.1); Has 8421 Blast hits to 8407 proteins in 2362 species: Archae - 0; Bacteria - 5801; Metazoa - 904; Fungi - 180; Plants - 375; Viruses - 4; Other Eukaryotes - 1157 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:8609495..8612383 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 67362.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 599 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSLSCPTYR SRTSSSSPFL SNHHHSSLIN VVDPRRSLSF HYASPQGLNL AELCVVRSQR RSVQSSVVVQ DGSVATESSS SEEAKDVGVL TIPSLEADKV 101: VAESDGGEQL STVSITVVGA SGDLAKKKIF PALFALYYEG CLPEHFTIFG YARSKMTDAE LRVMVSKTLT CRIDKRANCG EKMEEFLKRC FYHSGQYDSQ 201: EHFVALDEKL KEHEGGRLSN RLFYLSIPPN IFVDAVKCAS SSASSVNGWT RVIVEKPFGR DSKTSAALTK SLKQYLEEDQ IFRIDHYLGK ELVENLSVLR 301: FSNLIFEPLW SRQYIRNVQF IFSEDFGTEG RGGYFDNYGI IRDIMQNHLL QILALFAMET PVSLDAEDIR NEKVKVLRSM RPIKLEDVVI GQYKSHSIGG 401: VTYPSYTDDK TVPKGSLTPT FAAAALFIDN ARWDGVPFLM KAGKALNTRS AEIRVQFRHV PGNLYNRNSG TDRDQTTNEL VIRVQPDEAI YLKINNKVPG 501: LGMRLDQSNL NLLYSARYSK EIPDAYERLL LDAIEGERRL FIRSDELDAA WALFTPLLKE IEEKKTTPEF YPYGSRGPVG AHYLAAKHKV QWGDLSLDQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)