AT1G09795.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ATP phosphoribosyl transferase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ATP phosphoribosyl transferase, catalyses first step of histidine biosynthesis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATP phosphoribosyl transferase 2 (ATP-PRT2); FUNCTIONS IN: ATP phosphoribosyltransferase activity; INVOLVED IN: histidine biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Histidine biosynthesis HisG: ATP phosphoribosyltransferase (InterPro:IPR001348), ATP phosphoribosyltransferase, conserved site (InterPro:IPR018198), ATP phosphoribosyltransferase, catalytic domain (InterPro:IPR013820), Histidine biosynthesis HisG, C-terminal (InterPro:IPR013115), Nitrogen regulatory PII-like, alpha/beta (InterPro:IPR011322); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ATP phosphoribosyl transferase 1 (TAIR:AT1G58080.1); Has 6354 Blast hits to 6354 proteins in 2167 species: Archae - 206; Bacteria - 4075; Metazoa - 2; Fungi - 141; Plants - 71; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1859 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:3173588..3176690 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44759.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.78 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 413 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPISIPLNAT LQYSSPSSSS SSSSLVPSSP LFSPIPSTTV SLTGIRQRCL RMVTSCVSNA QKSVLNGATD SVSVVGREQI RLGLPSKGRM AADSLDLLKD 101: CQLFVKQVNP RQYVAQIPQL PNTEVWFQRP KDIVRKLLSG DLDLGIVGLD IVGEFGQGNE DLIIVHEALN FGDCHLSLAI PNYGIFENIK SLKELAQMPQ 201: WTEERPLRVA TGFTYLGPKF MKDNGIKHVT FSTADGALEA APAMGIADAI LDLVSSGTTL KENNLKEIEG GVVLESQAAL VASRRALTER KGALETVHEI 301: LERLEAHLKA NGQFTVVANM RGTDAEEVAE RVKTQPSLSG LQGPTISPVY CKRDGKVTIE YYAIVICVPK KALYESVQQL RAVGGSGVLV SPVTYIFHEE 401: TPRWSQLLSN LGL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)