AT1G09780.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
Phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent; FUNCTIONS IN: manganese ion binding, phosphoglycerate mutase activity, 2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase activity, catalytic activity, metal ion binding; INVOLVED IN: response to cadmium ion, response to cold; LOCATED IN: mitochondrial envelope, cytosol, chloroplast, plasma membrane; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha (InterPro:IPR017849), Metalloenzyme (InterPro:IPR006124), BPG-independent PGAM, N-terminal (InterPro:IPR011258), Alkaline-phosphatase-like, core domain (InterPro:IPR017850), Phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent (InterPro:IPR005995); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent (TAIR:AT3G08590.2); Has 4822 Blast hits to 4813 proteins in 1698 species: Archae - 54; Bacteria - 3035; Metazoa - 34; Fungi - 85; Plants - 379; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1235 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:3165550..3167812 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 60582.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 557 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSSAWKLD DHPKLPKGKT IAVIVLDGWG ESAPDQYNCI HNAPTPAMDS LKHGAPDTWT LIKAHGTAVG LPSEDDMGNS EVGHNALGAG RIFAQGAKLC 101: DQALASGKIF EGEGFKYVSE SFETNTLHLV GLLSDGGVHS RLDQLQLLIK GSAERGAKRI RVHILTDGRD VLDGSSVGFV ETLEADLVAL RENGVDAQIA 201: SGGGRMYVTL DRYENDWEVV KRGWDAQVLG EAPHKFKNAV EAVKTLRKEP GANDQYLPPF VIVDESGKAV GPIVDGDAVV TFNFRADRMV MHAKALEYED 301: FDKFDRVRYP KIRYAGMLQY DGELKLPSRY LVSPPEIDRT SGEYLTHNGV STFACSETVK FGHVTFFWNG NRSGYFNEKL EEYVEIPSDS GISFNVQPKM 401: KALEIGEKAR DAILSGKFDQ VRVNIPNGDM VGHTGDIEAT VVACEAADLA VKMIFDAIEQ VKGIYVVTAD HGNAEDMVKR DKSGKPALDK EGKLQILTSH 501: TLKPVPIAIG GPGLAQGVRF RKDLETPGLA NVAATVMNLH GFVAPSDYEP TLIEVVE |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)