AT1G03600.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : photosystem II family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
PSB27; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: photosystem II repair; LOCATED IN: thylakoid, chloroplast thylakoid membrane, chloroplast thylakoid lumen, chloroplast photosystem II, chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; Has 273 Blast hits to 273 proteins in 82 species: Archae - 0; Bacteria - 114; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 63; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 96 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:898916..899440 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 18835.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.50 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 174 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASASATATL LKPNLPPHKP TIIASSVSPP LPPPRRNHLL RRDFLSLAAT STLLTQSIQF LAPAPVSAAE DEEYIKDTSA VISKVRSTLS MQKTDPNVAD 101: AVAELREASN SWVAKYRKEK ALLGKASFRD IYSALNAVSG HYVSFGPTAP IPAKRKARIL EEMETAEKAL TRGR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)